El museo cuenta con 176 obras expuestas permanentemente al público, distribuidas en seis salas que llevan el nombre de destacadas personalidades de la Acuarela: Edagardo Coghlan, Vicente Mendiola, Ignacio Barrios, Ignacio M. Beteta, Pastor Velázquez y Benito Nogueira.
Asimismo se encuentra una sala dedicada a las versiones má recientes del Concurso Nacional de Acuarela sobre temas turísticos del Estado de México, en la que figuran las obras de Alicia Leyva, Demetrio Llorden, Angel Mauro, Irene Gavuzzo Gerard y Gloria Templador, por mencionar algunos.
Por otra parte, la galeria es uno de los servicios que el museo ofrece al Visitante; en este espacio se encuentra a la venta, a precios accesibles, obras en acuarela, pintadas por excelentes artistas, litografías, grabado, libros, y cárteles. Otro de los servicios es el centro de documentación del Museo, donde el interesado en la vida y obra de los artistas exponentes tiene acceso a dicha información, así como a datos generales de la técnica de la Acuarela y las artes plásticas.