No se conoce el nombre original de El Meco y se dice que su nombre proviene del apodo de un residente del siglo XIX.

La primera ocupación del sitio tuvo lugar en el Clásico Temprano, cuando era una pequeña aldea de pescadores posiblemente vinculada a sitios mayores como Cobá.

El pequeño poblado fue abandonado hacia el 600 d.C. y fue reocupado después por itzaes de Chichén Itzá y, posteriormente, por cocomes de Mayapán.

A partir de 1200 d.C., debido a su privilegiada situación geográfica y a su utilidad para la navegación. El Meco adquirió mayor importancia ante el incremento de la explotación de los ricos costeros de la zona.

Es probable que el asentamiento se consolidara como centro de funciones civiles y religiosas de importancia, carácter que conservaría hasta la llegada de los españoles.

La parte del sitio que se ha explorado incluye una plaza de carácter político y ceremonial, con estructuras palaciegas y administrativas en su entorno.

Estructura 1 (el Castillo): Basamento de planta cuadrangular y cuatro cuerpos, rematado por un templo que muestra manufactura del estilo Costa Oriental. En la escalinata de la etapa constructiva más reciente se ven restos de figuras serpentinas.

Estructura 8: Edificación administrativa a la que posteriormente se le añadió un pequeño templo en el lado oriental.

Estructura 12: Enorme palacio que mantiene la mayor parte de las columnas que sostuvieron su techo. Es probable que en este sitio se realizaran actividades de índole política y administrativa. Junto se conservan plataformas que completan la organización arquitectónica del conjunto.